Всероссийская коллекция микроорганизмов – ВКМ, Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН, Пущино
Участие в работе по реализации Государственной программы «Биоразнообразие» в течение 1999-2001 годов по созданию Консолидированного каталога Российских микробных коллекций. ВКМ – головная организация, координирующая работы по созданию информационной системы доступа к микробным генетическим ресурсам. В Объединенном каталоге Российских коллекций немедицинского профиля, опубликованном в виде электронной книги (http://www.vkm.ru/collections, http://sevin.ru/collections), представлено 900 детально охарактеризованных бактериальных штаммов из коллекции алканотрофных микроорганизмов ИЭГМ. Сотрудники лаборатории выражают огромную признательность и благодарность чл.-корр. РАН, д.б.н., профессору Л.В. Калакуцкому за постоянную консультационную помощь и моральную поддержку при разработке концепции профиля первой на Урале коллекции микробных ресурсов и в ее практической организации.
Институт технической химии УрО РАН, Пермь, Институт органической химии имени Н.Н. Ворожцова СО РАН, Новосибирск
В рамках договоров о научно-техническом сотрудничестве с целью создания перспективных фармакологических средств на основе доступных соединений ведутся исследования по разработке биокатализаторов процессов трансформации стеринов растительного происхождения (β-ситостерола, в частности, для получения андростановых производных); окисления сульфидов в оптически активные сульфоксиды, перспективные в качестве фармаконов и интермедиатов для получения современных противомикробных и противоопухолевых лекарственных препаратов.
Пермская государственная фармацевтическая академия, Институт элементоорганических соединений им. А.Н. Несмеянова РАН, Москва
Ведутся совместные исследования по созданию биотехнологии утилизации некачественных лекарственных средств - фальсифицированных, бракованных, с истекшим сроком годности. На примере ацетаминофенола (парацетамола) с истекшим сроком годности изучена способность актинобактерий родов Dietzia, Gordonia и Rhodococcus к биодеструкции непригодных к медицинскому использованию лекарственных средств, содержащих в своей структуре фенольную гидроксильную группу. Разработаны математическая модель и технологическая схема процесса деструкции парацетамола в виде фармацевтической субстанции и целых таблеток с использованием иммобилизованных клеток родококков с предварительно индуцированным алканотрофным обменом. Исследования поддержаны грантами РФФИ.
Пермский государственный университет
На базе лаборатории проходят научно-производственную практику, выполняют экспериментальные курсовые и дипломные проекты, выпускные работы бакалавров и магистерские диссертации выпускники кафедры микробиологии и иммунологии ПГУ.
Напиер университет (Napier University), Исследовательский центр оценки и ремедиации загрязненных земель Эдинбургского университета (Contaminated Land Assessment and Remediation Research Centre), Эдинбург, Великобритания
В рамках договоров о научном сотрудничестве ведутся многолетние исследования в области физиологии, биохимии и молекулярной биологии актинобактерий и по использованию их в биотехнологии защиты окружающей среды. Разработан метод видовой дифференциации актинобактерий рода Rhodococcus на основе видоспецифической ПЦР-амплификации 16S-РНК гена; изучены механизмы синтеза и разработан оригинальный метод выделения биосурфактантов, продуцируемых родококками при росте на жидких углеводородах; обоснована возможность использования Rhodococcus-биосурфактантов для интенсификации процесса биоремедиации нефтезагрязненных почв.Разработан экспрессный метод детекции полициклических ароматических углеводородов в почве на основе УФ спектрофотометрии при длинах волн 254 и 288 нм. Настоящий метод не требует значительных материальных и временных затрат и пригоден для мониторинга данных приоритетных загрязнителей в полевых условиях. Исследования поддержаны грантами Королевского научного общества Великобритании (The Royal Society), 1997-1999; Международной программы НАТО “The NATO Sciences Programme and Cooperation Parthers” 1999-2000, 2006-2007; “Green Curtain” Компании "Ford Motors" в области сохранения окружающей среды “Conservation and Environmental Grants”, 2001-2002; ИНТАС - INTAS-International Association for the promotion of co-operation with scientists from the New Independent States of the former Soviet Union, 2002-2003, 2004-2005. С британской стороны в работе участвовали профессор Н. Кристофи (N. Christofi, Prof., Director, Pollution Research Unit, School of Life Sciences, Napier University), д-р Дж. К. Филп (J.C. Philp, PhD, Dr., Napier University), д-р Д. Оу (D. Aw, PhD, Dr.), д-р C. Дунбар (S.A. Dunbar, Napier University), д-р К. Каннингхэм (C.J. Cunningham, Director, CLARRC), д-р Т. Пешкур (T. Peshkur, CLARRC), д-р П. Андерсон (P. Anderson, CLARRC).
German Research Centre for Biotechnology, Braunschweig (Германский биотехнологический центр, Брауншвейг)
Впервые установлено, что родококки R. ruber синтезируют биосурфактанты гликолипидной природы, в составе которых наряду с трегалозодимиколатом (С40), обнаруживаются диацилтрегалоза (С13-15) и моноацилтрегалоза (С10-14) – доминирующий компонент, характеризующийся более выраженной полярностью по сравнению с таковой трегалозомономиколатов, выделенных ранее из коринебактерий, микобактерий и представителей R. еrythropolis. С немецкой стороны в работе участвовали профессор З. Ланг (S. Lang, Prof. ) и д-р В. Врей (V. Wray).
“HÓDMARKET Kereskedeleszervezö ės Vállakozási Kft”, Szeged, Hungary (Компания «ХОДМАРКЕТ», Зегед, Венгрия) Ведутся совместные исследования по изучению природных углеводородокисляющих бактериоценозов и разработке эффективных способов биоремедиации техногенно-нарушенных земель на территории Задунайского района Венгерской Республики. При этом используются различные варианты биопрепарата, адаптированные к конкретным экологическим условиям, включающие чистые культуры R. erythropolis, R. ruber и Micrococcus luteus, способные разрушать тяжелые парафины и полициклические ароматические углеводороды (ПАУ), устойчивые к высоким концентрациям (МИК= 1,2-5,0 мМ) солей тяжелых металлов (Cd, Zn, Ni, Cu, Mo, Pb, Cr, V) и активные в условиях повышенной кислотности (рН 2-6) и засоленности (5-7% NaCl). С целью стабилизации функциональной активности биодеструкторов углеводородных соединений используется прием адсорбционной иммобилизации бактериальных клеток на твердых органических носителях, гидрофобизованных Rhodococcus-биосурфактантом. В качестве носителей применяются доступные в регионе и относительно дешевые материалы (кукурузные початки, в частности). Применение разработанной технологической схемы восстановления нефтезагрязненных почв обеспечивает в течение 4-6 месяцев 75-80%-ную эффективность очистки почвы с изначально высоким уровнем загрязнения. При этом содержание остаточных нефтепродуктов в очищенной почве не превышает 1,0 вес. %. Анализ содержания нефти в почве проводили весовым методом после экстракции хлороформом, структурный анализ остаточных нефтепродуктов – методом хромато-масс-спектрометрии, ПАУ – с помощью разработанного экспрессного метода детекции данных приоритетных загрязнителей на основе УФ-спектрофотометрии при длинах волн 254 и 288 нм. С венгерской стороны в работе участвовали д-р Арпад Сцабо (Dr. D. Szabó Árpád) и д-р Тибор Амбрус(Dr. AmbrusTibor).
World Federation for Culture Collections – WFCC (Всемирная Федерация коллекций культур – ВФКК)
Созданная коллекция алканотрофных микроорганизмов является членом WFCC (номер 768, акроним ИЭГМ), входит в мировой фонд коллекций культур (World Directory of Collections of Cultures of Microorganisms, Fifth Edition. 1999. Eds. H. Sugawara & S. Miyazaki. WFCC-MIRCEN World Data Centre for Microorganisms). В 1996 г. и 2000 г. Ившина И.Б. на Международных конгрессах (Вельдховен, Нидерланды; Бризбан, Австралия) была избрана в состав Исполнительного комитета WFCC (1996-2000; 2000-2003); в 1999 г. участвовала в качестве приглашенного эксперта-микробиолога в обсуждении Международного проекта MOSAICC «Устойчивое использование микроорганизмов и Международный свод правил доступа к микробным генетическим ресурсам» («Microorganisms Sustainable Use and Access Regulation International Code of Conduct», Брюссель, Бельгия), в 2000 г. работала в составе Международного комитета по присуждению Международной премии по систематике и таксономии микроорганизмов имени Скермана (Skerman Award 2000).
