В ИЭГМ открыта аспирантура по специальностям:
03-00-07 - «Микробиология»,
14-00-36 - «Аллергология и иммунология».
В 2001 году в институте была открыта докторантура по специальностям:
03.00.07 - Микробиология (биологические и медицинские науки)
14.00.36 - Аллергология и иммунология (медицинские науки)
